Проведена экстракция ДНК дальневосточного трепанга Apostichopus japonicus (Selenka, 1867) из амбулакральных ножек и из продольной мышцы тела (в качестве контроля). Выделенная из амбулакральных ножек ДНК оказалась высокого качества, с ней можно проводить дальнейшие молекулярно-генетические исследования. Возможность получать генетический материал из живой особи открывает новые перспективы для мониторинга популяций, возврата особей в среду, а также отбора гидробионтов с высоким полиморфизмом для разведения в условиях аквакультуры.
Проведена оценка минимального количества микросателлитных локусов, необходимых для первичного анализа популяционной структуры на примере выборок дальневосточного трепанга . Всего было использовано 10 микросателлитных маркёров как максимальное количество, взятое для анализа. На основе средних значений аллельного богатства и F для каждого локуса по всем выборкам постепенно убирали по одному маркёру с наименьшими значениями этих показателей и проводили байесовскую кластеризацию с определением параметров для вычисления оптимального количества групп. Показано, что генотипическое распределение особей достигается при девяти локусах в анализе и выше при их ранжировании на основе аллельного богатства и дифференцирующей способности. Стоит отметить, что необходима дальнейшая работа по поиску эффективных молекулярных маркёров для изучения гетерогенности популяции дальневосточного трепанга.
Indexing
Scopus
Crossref
Higher Attestation Commission
At the Ministry of Education and Science of the Russian Federation