Проведена экстракция ДНК дальневосточного трепанга Apostichopus japonicus (Selenka, 1867) из амбулакральных ножек и из продольной мышцы тела (в качестве контроля). Выделенная из амбулакральных ножек ДНК оказалась высокого качества, с ней можно проводить дальнейшие молекулярно-генетические исследования. Возможность получать генетический материал из живой особи открывает новые перспективы для мониторинга популяций, возврата особей в среду, а также отбора гидробионтов с высоким полиморфизмом для разведения в условиях аквакультуры.
Проведена оценка минимального количества микросателлитных локусов, необходимых для первичного анализа популяционной структуры на примере выборок дальневосточного трепанга . Всего было использовано 10 микросателлитных маркёров как максимальное количество, взятое для анализа. На основе средних значений аллельного богатства и F для каждого локуса по всем выборкам постепенно убирали по одному маркёру с наименьшими значениями этих показателей и проводили байесовскую кластеризацию с определением параметров для вычисления оптимального количества групп. Показано, что генотипическое распределение особей достигается при девяти локусах в анализе и выше при их ранжировании на основе аллельного богатства и дифференцирующей способности. Стоит отметить, что необходима дальнейшая работа по поиску эффективных молекулярных маркёров для изучения гетерогенности популяции дальневосточного трепанга.
Индексирование
Scopus
Crossref
Высшая аттестационная комиссия
При Министерстве образования и науки Российской Федерации